Inçekeseli anyklamak we neşe serişdelerine garşylygy kesgitlemek üçin täze ýarag: Inçekesele aşa duýgurlygy anyklamak üçin maşyn öwrenmek bilen birleşdirilen täze nesil maksatly yzygiderlilik (tNGS)
Edebiýat hasabaty: CCa: az bakteriýaly inçekesel we inçekesel meningitli adamlar üçin amatly bolan tNGS we maşyn öwrenişine esaslanýan anyklaýyş modeli.
Tezisiň ady: Inçekesele gönükdirilen indiki nesil yzygiderliligi we maşyn öwrenmek: öýken turbalary we turba meningiti üçin aşa duýgur anyklaýyş strategiýasy.
Döwürleýin: 《Clinica Chimica Acta》
IF : 6.5
Çap edilen senesi: 2024-nji ýylyň ýanwar aýy
Hytaýyň Ylymlar akademiýasy we Pekin lukmançylyk uniwersitetiniň Pekin sandyk hassahanasy bilen bilelikde “Makro & Micro-Test” inçekesele garşy anyklaýyş modelini döretdi, maksatly yzygiderlilik (tNGS) tehnologiýasy we maşyn öwrenmek usuly, inçekesel üçin aşa ýokary kesgitleýiş duýgurlygyny üpjün edýän, inçekeseli anyklamak we iki görnüşli inçekesele garşy anyklaýyş usuly, inçekesele garşy anyklaýyş usuly, inçekeseli anyklamak we iki görnüşli inçekeseli anyklamak usuly, inçekesele garşy anyklaýyş usuly, inçekeseli anyklamak usuly, iki görnüşli inçekesele garşy anyklaýyş usuly, inçekeseli anyklaýyş usuly, inçekeseli anyklaýyş usuly, inçekeseli anyklaýyş usuly, inçekeseli anyklaýyş usuly, inçekeseli anyklaýyş usuly, inçekeseli anyklamak usuly, inçekeseli anyklaýyş usuly, inçekeseli anyklaýyş usuly we inçekeseli anyklaýyş usuly bilen üpjün etdi. inçekesel. Şol bir wagtyň özünde, näsagyň plazma cfDNA-synyň TBM diagnozynda kliniki nusga almak üçin amatly nusga görnüşi hökmünde ulanylyp bilinjekdigi anyklandy.
Bu gözlegde, iki kliniki koort döretmek üçin 227 plazma nusgasy we serebrospinal suwuklyk nusgasy ulanyldy, onda inçekesel diagnozynyň maşyn öwreniş modelini döretmek üçin laboratoriýa anyklaýyş kohort nusgalary we kesgitlenen anyklaýyş modelini barlamak üçin kliniki anyklaýyş kohort nusgalary ulanyldy. Samhli nusgalar ilki bilen Mikobakteriýa inçekeseli üçin ýörite işlenip düzülen gözleg howzy tarapyndan nyşana alyndy. Soňra, TB-tNGS yzygiderlilik maglumatlaryna esaslanyp, karar agajynyň modeli laboratoriýa diagnostika nobatynyň okuw we tassyklama toplumlarynda 5 esse kesişmek üçin ulanylýar we plazma nusgalarynyň we serebrospinal suwuklyk nusgalarynyň anyklaýyş çäkleri alynýar. Alnan bosagany ýüze çykarmak üçin kliniki diagnoz nobatynyň iki synag toplumyna getirilýär we okuwçynyň anyklaýyş netijesi ROC egrisi bilen bahalandyrylýar. Ahyrynda inçekeseliň anyklaýyş modeli alyndy.
Gözleg dizaýnynyň 1-nji shemasy
Netijeler: 227 nusganyň arasynda CSF DNK nusgasynyň (AUC = 0.974) we plazma cfDNA nusgasynyň (AUC = 0.908) kesgitlenen çäklerine görä, CSF nusgasynyň duýgurlygy 97.01%, aýratynlygy 95.65%, plazma nusgasynyň duýgurlygy we aýratynlygy 82,61% we 86.36% boldy. TBM hassalaryndan plazma cfDNA we serebrospinal suwuklyk DNK-nyň 44 jübüt nusgasynyň seljermesinde bu gözlegiň anyklaýyş strategiýasy plazma cfDNA we serebrospinal suwuklyk DNK-da 90,91% (40/44) ýokary yzygiderliligi we duýgurlygy 95,45% (42/44). Öpük inçekeseli bolan çagalarda bu gözlegiň anyklaýyş strategiýasy, şol bir näsaglardan (28.57% VS 15.38%) aşgazan şiresi nusgalarynyň Xpert kesgitleme netijelerine garanyňda plazma nusgalaryna has duýgur bolýar.
2-nji surat Ilatyň nusgalary üçin inçekeseli anyklaýyş modeliniň seljermesi
3-nji surat Jübütlenen nusgalaryň anyklaýyş netijeleri
Netije: Bu işde inçekesel üçin aşa duýgur diagnostika usuly döredildi, oligobasillary inçekeseli (negatiw medeniýeti) kliniki näsaglar üçin iň ýokary kesgitleýiş duýgurlygy bilen anyklaýyş guralyny üpjün edip biler. Plazma cfDNA esasynda aşa duýgur inçekeseli ýüze çykarmak, işjeň inçekeseli we inçekesel meningitini anyklamak üçin amatly nusga görnüşi bolup biler (beýni inçekeselinden şübhelenýän hassalar üçin serebrospinal suwuklykdan plazma nusgalaryny ýygnamak has aňsat).
Asyl baglanyşyk: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990? % 3Dihub arkaly
“Makro & Micro-Test” inçekesel tapgyryny anyklaýyş önümleriniň gysgaça tanyşdyrylyşy
Inçekesel bilen kesellänleriň çylşyrymly nusga ýagdaýyny we dürli zerurlyklary göz öňünde tutup, “Makro & Micro-Test” tüýkülik nusgalaryndan suwuklygy çykarmak, “Qualcomm” kitaphanasynyň gurluşygy we yzygiderliligi we maglumatlar derňewi üçin NGS çözgütleriniň doly toplumyny hödürleýär. Önümler inçekesel bilen kesellänlere çalt diagnoz goýmagy, inçekeseliň neşe garşylygyny anyklamagy, mikobakteriýa inçekeselini we NTM-ni ýazmagy, bakteriýalara negatiw inçekeseliň we inçekeseliň aşa duýgur diagnozyny we ş.m.
Inçekesel we mikobakteriýalar üçin tapyndy toplumlary:
Nook | önümiň ady | önüm synag mazmuny | nusga görnüşi | ulanylýan model |
HWTS-3012 | Mysal üçin goýberiji agent | Tüýkülik nusgalaryny suwuklandyrmak bejergisinde ulanylýan, Sutong Machinery Equipment 20230047 birinji derejeli rekord belgisini aldy. | tüýkürik | |
HWTS-NGS-P00021 | Duýgur inçekesel üçin kwalkom mukdaryny kesgitlemek toplumy (gözleg usuly) | Bakteriýa-negatiw öýken inçekeseli we beýni düwünleri üçin invaziv däl (suwuk biopsiýa) aşa duýgurlygy kesgitlemek; Inçekesel ýa-da inçekesel däl mikobakteriýa ýokaşandygyna güman edilýän adamlaryň nusgalary ýokary çuňlukly yzygiderlilik metagenomikasy bilen seljerildi we inçekesel ýa-da inçekesel däl mikobakteriýa ýokaşandygyny ýa-da mikobakteriýa inçekeseliniň ilkinji birinji neşe garşylygy maglumatlary berildi. | Periferiýa gany, alveolýar lavaj suwuklygy, gidrotoraks we askitler, fokus punksiýa nusgasy, serebrospinal suwuklyk. | Ikinji nesil |
HWTS-NGS-T001 | Mikobakteriýany ýazmak we neşe garşylygy kesgitlemek toplumy (multiplex güýçlendirmek yzygiderliligi usuly) | MTBC we 187 NTM ýaly mikobakteriýa ýazmak synagy;Mikobakteriýa inçekeseliniň neşe garşylygy ýüze çykarylyşy 13 derman we neşe garşy genleriň 16 esasy mutasiýa ýerini öz içine alýar. | Tüýkülik, alveolýar lavaj suwuklygy, gidrotoraks we askitler, fokus punksiýa nusgasy, serebrospinal suwuklyk. | Ikinji / üçünji nesil goşa platforma |
Iň esasy pursatlar: HWTS-NGS-T001 Mikobakteriýany ýazmak we neşe garşylygy kesgitlemek toplumy (multiplex güýçlendirmek usuly)
Önümiň tanyşdyrylyşy
Önüm, Bütindünýä saglygy goraýyş guramasynyň inçekeseli bejermek boýunça görkezmelerinde, makrolidlerde we aminoglikozidlerde beýan edilen esasy birinji we ikinji derejeli dermanlara esaslanýar we neşe serişdelerine garşylykly ýerler BSGG-nyň mikobakteriýa inçekesel çylşyrymly mutasiýa katalogynda neşe garşylygy bilen baglanyşykly saýtlaryň bir toparyny, şeýle hem daşary ýurtlarda geçirilen barlaglara we statistiki maglumatlara görä neşe garşylygy genleri we mutasiýa saýtlary.
Typazuw kesgitlemesi, Hytaýyň inçekesel we dem alyş keselleri Journalurnaly tarapyndan neşir edilen NTM görkezmelerinde jemlenen NTM ştamlaryna we hünärmenleriň razylygyna esaslanýar. Taslanan ýazuw desgalary 190-dan gowrak NTM görnüşini güýçlendirip, yzygiderlilikde we düşündirip biler.
Maksatly multiplex PCR güýçlendirmek tehnologiýasy arkaly, mikobakteriýanyň genotip genleri we neşe garşy durnukly genleri multiplex PCR arkaly güýçlendirildi we ýüze çykaryljak maksatly genleriň amplikon kombinasiýasy alyndy. Güýçlendirilen önümler ikinji nesil ýa-da üçünji nesil ýokary geçişli yzygiderli kitaphanalara gurlup bilner we ikinji nesil we üçünji nesil yzygiderlilik platformalary maksatly genleriň yzygiderliligi barada maglumat almak üçin ýokary çuňluga sezewar edilip bilner. Içerki maglumat bazasyndaky (BSGG Mikobakteriýa inçekesel çylşyrymly mutasiýa katalogy we onuň neşe garşylygy bilen gatnaşygy) öz içine alýan belli mutasiýa bilen deňeşdirip, neşe garşylygy ýa-da inçekesele garşy dermanlaryň duýgurlygy bilen baglanyşykly mutasiýa kesgitlenildi. “Makro & Micro-Test” -iň öz-özünden açylan tüýkülik bejergisi çözgüdi bilen utgaşyp, kliniki tüýkülik nusgalarynyň pes nuklein kislotasyny güýçlendirmek netijeliligi (adaty usullardan on esse ýokary) çözüldi, şonuň üçin neşe garşylygy yzygiderliligini kesgitlemek kliniki tüýkülik nusgalaryna gönüden-göni ulanylyp bilner.
Önümi kesgitlemek diapazony
34neşe garşylygy bilen baglanyşykly genler18inçekesele garşy dermanlar we6Örtýän NTM dermanlary tapyldy297neşe garşy ýerler; Mikobakteriýa inçekeseliniň on görnüşi we ondanam köp190NTM görnüşleri tapyldy.
1-nji tablisa: 18 + 6 neşe serişdeleri + 190 + NTM barada maglumat
Önümiň artykmaçlygy
Güýçli kliniki uýgunlaşma: tüýkürigiň nusgalaryny medeniýetsiz öz-özüni suwuklandyryjy serişde bilen gönüden-göni tapyp bolýar.
Synag işi ýönekeý: güýçlendirmek işiniň birinji tapgyry ýönekeý we kitaphananyň gurluşygy 3 sagadyň içinde tamamlanýar, bu bolsa işiň netijeliligini ýokarlandyrýar.
Giňişleýin ýazmak we neşe garşylygy: kliniki aladanyň esasy nokatlary bolan MTB we NTM-iň ýazuw we neşe garşylykly ýerlerini öz içine alýar, takyk ýazmak we neşe garşylygy anyklamak, garaşsyz derňew programma üpjünçiligini goldamak we bir gezek basmak bilen derňew hasabatlaryny döretmek.
Gabat gelmek: esasy ILM we MGI / ONT platformalaryna uýgunlaşmak, önümiň utgaşyklygy.
Önümiň spesifikasiýasy
Haryt kody | önümiň ady | Ectionüze çykarmak platformasy | aýratynlyklary |
HWTS-NGS-T001 | Mikobakteriýany ýazmak we neşe garşylygy kesgitlemek toplumy (multiplex güýçlendirmek usuly) | ONT 、 Illumina 、 MGI 、 Salus pro | 16 / 96rxn |
Iş wagty: -20anwar-23-2024