Inçekeseli anyklamak we neşe serişdelerine garşylygy kesgitlemek üçin täze ýarag: Inçekesele aşa duýgurlygy anyklamak üçin maşyn öwrenmek bilen birleşdirilen täze nesil maksatly yzygiderlilik (tNGS)
Edebiýat hasabaty: CCa: az bakteriýaly inçekesel we inçekesel meningitli adamlar üçin amatly bolan tNGS we maşyn öwrenişine esaslanýan anyklaýyş modeli.
Tezisiň ady: Inçekesele gönükdirilen indiki nesil yzygiderliligi we maşyn öwrenmek: öýken turbalary we turba meningiti üçin aşa duýgur anyklaýyş strategiýasy.
Döwürleýin: 《Clinica Chimica Acta》
IF ： 6.5
Çap edilen senesi: 2024-nji ýylyň ýanwar aýy
Hytaýyň Ylymlar akademiýasy we Paýtagt lukmançylyk uniwersitetiniň Pekin sandyk hassahanasy bilen bilelikde “Makro & Micro-Test” täze nesli maksatly yzygiderlilik (tNGS) tehnologiýasy we maşyn öwrenmek usuly esasynda inçekesel anyklaýyş modelini döretdi, bu ýokary derejäni üpjün etdi. Az bakteriýalar we inçekesel meningitli inçekesele duýgurlygy, inçekeseliň iki görnüşini kliniki anyklamak üçin täze duýgurlyk diagnoz usulyny üpjün etdi we inçekeseli anyklamaga, neşe garşylygyny anyklamaga we bejermekde kömek etdi.Şol bir wagtyň özünde, näsagyň plazma cfDNA-syny TBM diagnozynda kliniki nusga almak üçin amatly nusga görnüşi hökmünde ulanyp boljakdygy anyklandy.
Bu gözlegde, iki sany kliniki koort döretmek üçin 227 plazma nusgasy we serebrospinal suwuklyk nusgasy ulanyldy, onda inçekesel diagnozynyň maşyn öwreniş modelini döretmek üçin laboratoriýa anyklaýyş kohort nusgalary we döredilenleri barlamak üçin kliniki anyklaýyş kohort nusgalary ulanyldy. anyklaýyş modeli.Samhli nusgalar ilki bilen Mikobakteriýa inçekeseli üçin ýörite işlenip düzülen gözleg howzy tarapyndan nyşana alyndy.Soňra, TB-tNGS yzygiderlilik maglumatlaryna esaslanyp, karar agajynyň modeli laboratoriýa diagnostika nobatynyň okuw we tassyklama toplumlarynda 5 esse kesişmek üçin ulanylýar we plazma nusgalarynyň we serebrospinal suwuklyk nusgalarynyň anyklaýyş çäkleri alynýar.Alnan bosagany ýüze çykarmak üçin kliniki diagnoz nobatynyň iki synag toplumyna getirilýär we okuwçynyň anyklaýyş işine ROC egrisi bilen baha berilýär.Ahyrynda inçekeseliň anyklaýyş modeli alyndy.
Gözleg dizaýnynyň 1-nji shemasy
Netijeler: Bu gözlegde kesgitlenen CSF DNK nusgasynyň (AUC = 0.974) we plazma cfDNA nusgasynyň (AUC = 0.908) kesgitlenen çäklerine görä, 227 nusganyň arasynda CSF nusgasynyň duýgurlygy 97.01%, aýratynlygy 95,65% we plazma nusgasynyň duýgurlygy we aýratynlygy 82,61% we 86.36% boldy.TBM näsaglaryndan plazma cfDNA we serebrospinal suwuklyk DNK-nyň 44 jübüt nusgasynyň seljermesinde bu gözlegiň anyklaýyş strategiýasy plazma cfDNA we serebrospinal suwuklyk DNK-da 90,91% (40/44) ýokary yzygiderliligi we duýgurlygy 95,45% (42/44).Öpük inçekeseli bolan çagalarda bu gözlegiň anyklaýyş strategiýasy, şol bir näsaglardan (28.57% VS 15.38%) aşgazan şiresi nusgalarynyň Xpert kesgitleme netijelerine garanyňda plazma nusgalaryna has duýgur bolýar.
2-nji surat Ilatyň nusgalary üçin inçekeseli anyklaýyş modeliniň seljermesi
3-nji surat Jübütlenen nusgalaryň anyklaýyş netijeleri
Netije: Bu işde inçekesel üçin aşa duýgur diagnostika usuly döredildi, oligobasillary inçekeseli (negatiw medeniýeti) kliniki näsaglar üçin iň ýokary kesgitleýiş duýgurlygy bilen anyklaýyş guralyny üpjün edip biler.Plazma cfDNA esasynda aşa duýgur inçekeseli ýüze çykarmak, işjeň inçekeseli we inçekesel meningitini anyklamak üçin amatly nusga görnüşi bolup biler (beýni inçekeselinden şübhelenýän hassalar üçin serebrospinal suwuklykdan plazma nusgalaryny ýygnamak has aňsat).
Asyl baglanyşyk: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990?% 3Dihub arkaly
“Makro & Micro-Test” inçekesel tapgyryny anyklaýyş önümleriniň gysgaça tanyşdyrylyşy
Inçekesel bilen kesellänleriň çylşyrymly nusga ýagdaýyny we dürli zerurlyklary göz öňünde tutup, “Makro & Micro-Test” tüýkülik nusgalaryndan suwuklygy çykarmak, “Qualcomm” kitaphanasynyň gurluşygy we yzygiderliligi we maglumatlar derňewi üçin NGS çözgütleriniň doly toplumyny hödürleýär.Önümler inçekesel bilen kesellänlere çalt diagnoz goýmagy, inçekeseliň neşe garşylygyny anyklamagy, mikobakteriýa inçekeselini we NTM-ni ýazmagy, bakteriýalara negatiw inçekeseliň we inçekeseliň aşa duýgur diagnozyny we ş.m.
Inçekesel we mikobakteriýalar üçin tapyndy toplumlary:
| Nook | önümiň ady | önüm synag mazmuny | nusga görnüşi | ulanylýan model |
| HWTS-3012 | Mysal üçin goýberiji agent | Tüýkülik nusgalaryny suwuklandyrmak bejergisinde ulanylýan, Sutong Machinery Equipment 20230047 birinji derejeli rekord belgisini aldy. | tüýkürik | |
| HWTS-NGS-P00021 | Duýgur inçekesel üçin kwalkom mukdaryny kesgitlemek toplumy (gözleg usuly) | Bakteriýa-negatiw öýken inçekeseli we beýni düwünleri üçin invaziv däl (suwuk biopsiýa) aşa duýgurlygy kesgitlemek;Inçekesel ýa-da inçekesel däl mikobakteriýa ýokaşandygyna güman edilýän adamlaryň nusgalary ýokary çuňlukly yzygiderlilik metagenomikasy bilen seljerildi, inçekesel ýa-da inçekesel däl mikobakteriýalaryň ýokaşandygyny ýa-da mikobakteriýa inçekeseliniň ilkinji nobatdaky neşe garşylyk maglumatlary. bilen üpjün edildi. | Periferiýa gany, alveolýar lavaj suwuklygy, gidrotoraks we askitler, fokus punksiýa nusgasy, serebrospinal suwuklyk. | Ikinji nesil |
| HWTS-NGS-T001 | Mikobakteriýany ýazmak we neşe garşylygy kesgitlemek toplumy (multiplex güýçlendirmek yzygiderliligi usuly) | MTBC we 187 NTM ýaly mikobakteriýa ýazmak synagy；Mikobakteriýa inçekeseliniň neşe garşylygy ýüze çykarylyşy 13 derman we neşe garşy genleriň 16 esasy mutasiýa ýerini öz içine alýar. | Tüýkülik, alveolýar lava suwuklygy, gidrotoraks we askitler, fokus punksiýa nusgasy, serebrospinal suwuklyk. | Ikinji / üçünji nesil goşa platforma |
Iň esasy pursatlar: HWTS-NGS-T001 Mikobakteriýany ýazmak we neşe garşylygy kesgitlemek toplumy (multiplex güýçlendirmek usuly)
Önümiň tanyşdyrylyşy
Önüm, Bütindünýä saglygy goraýyş guramasynyň inçekeseli bejermek boýunça görkezmelerinde, makrolidlerde we aminoglikozidlerde beýan edilen esasy birinji we ikinji hatar dermanlara esaslanýar we neşe garşylykly ýerler neşe garşylygy bilen baglanyşykly saýtlaryň bir toparyny öz içine alýar. Bütindünýä saglygy goraýyş guramasynyň mikobakteriýa inçekesel çylşyrymly mutasiýa katalogy, şeýle hem ýurtda we daşary ýurtlarda ýokary bahaly edebiýatlaryň derňewine we statistikasyna görä neşe garşylygy genleri we mutasiýa ýerleri.
Typazuw kesgitlemesi, Hytaýyň inçekesel we dem alyş keselleri Journalurnaly tarapyndan neşir edilen NTM görkezmelerinde jemlenen NTM ştamlaryna we hünärmenleriň razylygyna esaslanýar.Taslanan ýazuw desgalary 190-dan gowrak NTM görnüşini güýçlendirip, yzygiderlilikde we düşündirip biler.
Maksatly multiplex PCR güýçlendirmek tehnologiýasy arkaly, mikobakteriýanyň genotip genleri we neşe garşy durnukly genleri multiplex PCR arkaly güýçlendirildi we ýüze çykaryljak maksatly genleriň amplikon kombinasiýasy alyndy.Güýçlendirilen önümler ikinji nesil ýa-da üçünji nesil ýokary geçişli yzygiderli kitaphanalara gurlup bilner we ikinji nesil we üçünji nesil yzygiderlilik platformalary maksatly genleriň yzygiderliligi barada maglumat almak üçin ýokary çuňluga sezewar edilip bilner.Içerki maglumat bazasyndaky (BSGG Mikobakteriýa inçekesel çylşyrymly mutasiýa katalogy we onuň neşe garşylygy bilen gatnaşygy) öz içine alýan belli mutasiýa bilen deňeşdirip, neşe garşylygy ýa-da inçekesele garşy dermanlaryň duýgurlygy bilen baglanyşykly mutasiýa kesgitlenildi.“Makro & Micro-Test” -iň öz-özünden açylan tüýkülik bejergisi çözgüdi bilen utgaşyp, kliniki tüýkülik nusgalarynyň pes adaty nuklein kislotasyny güýçlendirmek (adaty usullardan on esse ýokary) meselesi çözüldi, şonuň üçin neşe garşylygy yzygiderliligini kesgitlemek bolar. kliniki tüýkülik nusgalaryna gönüden-göni ulanylýar.
Önümi kesgitlemek diapazony
34neşe garşylygy bilen baglanyşykly genler18inçekesele garşy dermanlar we6Örtýän NTM dermanlary tapyldy297neşe garşy ýerler;Mikobakteriýa inçekeseliniň on görnüşi we ondanam köp190NTM görnüşleri tapyldy.
1-nji tablisa: 18 + 6 neşe serişdeleri + 190 + NTM barada maglumat
Önümiň artykmaçlygy
Güýçli kliniki uýgunlaşma: tüýkürigiň nusgalaryny medeniýetsiz öz-özüni suwuklandyryjy serişde bilen gönüden-göni tapyp bolýar.
Synag işi ýönekeý: güýçlendirmek işiniň birinji tapgyry ýönekeý we kitaphananyň gurluşygy 3 sagadyň içinde tamamlanýar, bu bolsa işiň netijeliligini ýokarlandyrýar.
Giňişleýin ýazmak we neşe garşylygy: kliniki aladanyň esasy nokatlary bolan MTB we NTM-iň ýazuw we neşe garşylykly ýerlerini öz içine alýar, takyk ýazmak we neşe garşylygy anyklamak, garaşsyz derňew programma üpjünçiligini goldamak we bir gezek basmak bilen derňew hasabatlaryny döretmek.
Gabat gelmek: esasy ILM we MGI / ONT platformalaryna uýgunlaşmak, önümiň utgaşyklygy.
Önümiň spesifikasiýasy
| Haryt kody | önümiň ady | Ectionüze çykarmak platformasy | aýratynlyklary |
| HWTS-NGS-T001 | Mikobakteriýany ýazmak we neşe garşylygy kesgitlemek toplumy (multiplex güýçlendirmek usuly) | ONT 、 Illumina 、 MGI 、 Salus pro | 16 / 96rxn |
Iş wagty: -20anwar-23-2024